Per quanto riguarda il finanziamento proprio dei lavori di realizzazione del nuovo collegamento, l'Italia e la Francia hanno firmato il 5 maggio 2004 un memorandum secondo il quale l'Italia prevedeva di finanziare il 63% del costo della tratta trasfrontaliera di cui LTF è il promotore e la Francia il 37%; Italia e Francia partecipando tuttavia al 50% ciascuna sull’insieme della linea da Torino a Lione. E' previsto, come parte dell'atto aggiuntivo all'accordo intergovernativo del 2001 (ormai trattato) che deve essere sottoscritto da Italia e Francia alla fine del 2010, di ridefinire il finanziamento tra i due paesi.
Riguardo ai finanziamenti europei, nell’ambito del nuovo regolamento finanziario dei reti Trans-Europei (RTE) la Commissione europea ha proposto un tasso di finanziamento europeo fino al 30% massimo per la realizzazione di sezioni transfrontaliere di progetti prioritari di cui fa parte il progetto Torino-Lione.
Nel novembre 2007, l’UE ha assegnato nell’ambito del suo programma pluriennale (2007-2013) 671,80 milioni di euro alla sezione transfrontaliera della Torino-Lione.
Questo contributo fa parte di un finanziamento globale di 2,1 milliardi di euro per la stessa sezione per il periodo 2007-2013. Italia e Francia forniscono la maggior parte di questi fondi.